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已经在大都人眼中，基因检测仍旧是一项很悠远的手艺。但是新冠疫情突如其来，核酸检测以其疾速和精确的检测特征，一跃成为诊断和防控疫情的有用方法。操纵核酸检测停止新冠疫情的防控，是一次超大范围利用份子生物学检测手艺对新发感染病停止干涉的无益理论，也是一次让基因检测手艺疾速进入群众视野的特别“契机”。在追求开展的历程中，愈来愈多基因行业的研讨机构和企业发明，在鞭策基因手艺开展之时，保证后端算力尤其主要。因而，寻觅适宜支持基因测序开展的HPC（高机能计较处理计划）成为必需。云时期已来，让数据代价得以凸显、大数据手艺产品各处生花，那基因财产又该怎样乘势而发？基因测序本钱逐步低落让基因检测逐步提高，但应战老是与前进相伴相生----因为基因检测合用目的人群的疾速增加，检测的庞大度随之大幅提拔，不竭爬升和深化的数据需求让基因检测面对应战。金域医门生信总监孙明显已在生物信息行业深耕13年，面临如许的近况，他深有感到地说：“基因测序短工夫内就可以产出PB级的海量数据，因而只要经由过程更高机能的效劳器与更疾速的阐发算法，才气满意云云大批且多样化的数据需求，让数据代价得以更大水平的表现。“那终究甚么样的HPC才合适临床基因检测呢？孙明显给出谜底：“起首我们将检测需求停止场景分类，然后按照响应场景挑选适宜的HPC。”孙明显说：“将需求根据场景分类后，HPC的布置方法就开阔爽朗化了。但此中当地HPC因会遭到布置园地及供货周期的限制，假如碰到检丈量剧增的突发变乱，没法做到及时静态的硬件资本扩大。怎样处理？我们挑选了华为云供给的资本混淆调理计划，经由过程它静态拓展的特征处理了这个成绩。”他暗示，接纳了如今的整合方法后，当地HPC和云端HPC能够完成同一办理，只需设立一个同一的办理节点，就可以同时办理线下和云真个计较资本，当当地HPC负载太高时，数据阐发效劳会主动推送到云端，有用处理了当地算力不敷的搅扰。谈及将来，孙明显暗示：“今朝，金域医学的营业曾经笼盖了全部财产链上中下流。期望将来能与协作同伴配合勤奋，将大手艺平台、大效劳收集、大样本、大数据库结合起来，构建‘查验+’的生态圈，并经由过程这个生态圈放慢大样本、大数据、医检手艺立异的开展和打破。”在基因测序中，测序的长读长能有用提拔基因组组装的完好性。相关于二代测序，三代测序的长读长劣势，可以协助它打破二代测序短读长手艺在人类遗传疾病研讨、动动物基因组完成图组装等方面的瓶颈、提拔其在疾病诊断、份子育种中供给决议计划根据的才能。（备注：读长指的是测序反响所能测得序列的长度）

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三代测序的单张芯片的测序数据量会到达100Gb以上，而期望组消费中间一年将会耗损近万张测序芯片，算上衍生出的大于测序数据数倍的原始数据，三代测序所发生的数据量会是海量的，其数据存储与阐发契合大数据的特性。武汉期望组COO刘雷博士引见，在三代测序中，不管是PacBio测序仪仍是Oxford Nanopore测序仪，所发生的数据包罗了阐发所用的fastq数据，和这些数据的原始格局bam，fast5等；而这些bam，fast5格局常常会是原始数据的5~10倍。因而处置这些宏大的数据，关于算力的请求很高。那末终究甚么样的HPC是三代测序的“幻想型”呢？刘雷博士以为，因为基因测序的数据与数据隐私宁静互相关注，因而，契合请求的、幻想的HPC起首该当是宁静可控的，从而确保在庞大的情况中保证基因数据的宁静；其主要具有优良的性价比，在机能满意需求的同时尽能够节省本钱。“我们期望对计较资本停止公道分配，操纵私有云对大批非敏感营业停止疾速托付和流程调优，大批敏感营业运转于当地以满意企业对数据隐私保证的请求。基于上述思索，我们终极挑选了华为云供给的资本混淆调理计划完成全部计较资本的整合。该处理计划的多面性为我们供给了更多挑选，十分好地满意了我们对HPC的需求。”刘雷批评道。逐步完美的检测手艺和不竭低落的装备本钱使基因测序被愈来愈多的人承认，其宏大的开展潜力无庸置疑。刘雷暗示，在对峙三代测序手艺使用不竭迭代的同时，期望组将与协作同伴联袂共建基于生态测序的高机能计较机群，为全球的客户供给优良的生态测序阐发和存储的效劳。在基因检测才能提拔的同时，数据量也在不竭积累。能够必定的是，检测机构关于HPC的请求将愈来愈严苛。作为处理计划供应方的云厂商该怎样提拔合作力、为一日千里的医疗安康财产供给无力支持呢？华为云基因行业处理计划总监严斌暗示，幻想的HPC不只要满意用户对集群易用性和高机能的请求，还需思索综合性价比。华为云推出的资本混淆调理计划，不只能够一站式办理当地-私有云计较资本，还可办理x86假造机和鲲鹏假造机的混合伙源池，从而为客户供给更高性价比的HPC集群。同时，华为云还供给基因容器和医疗智能体等行业处理计划，从版本办理、形态监控、用度考核和资本耗损等多个维度对营业流程停止优化指点，从而进一步进步团体计划的性价比。“我们期望华为云作为行业的黑地盘，供给更多的立异计划，使能基因测序行业在云时期高速、不变和智能地开展前行。”严斌如是说。

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