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按照美国卫生部的应急预案，全美1400家社区医疗中间（community health center）仍将运营。这些诊所为2700万低支出生齿供给防备医疗、牙科和其他根本医疗效劳。不外，有大批联邦赞助的医学研讨项目、方案和一些医疗机构会即刻就会遭到联邦当局“关门”影响。好比国立卫生研讨所临床中间（NIH Clinical Center）承受联邦赞助，展开临床研讨。曾经到场临床研讨的病人将会持续承受照护，可是联邦当局“关门”时期不会再招募新的到场者。因为一些病人因通例疗法有效才到场临床研讨，临床研讨也是他们想捉住的“最初一根拯救稻草”，因而联邦当局“关门”或将招致一些病人没法参与临床研讨而丧命，并且“关门”工夫越长，影响越明显。用于间接病人医护的大部门联邦资金系专项拨款，不受***、共和两党在财务预算方案摆设上的不合争论影响，因而美国大众医疗保险中的两大基石—Medicare和Medicaid，险些不会遭到影响。假如联邦当局“关门”工夫短，Medicare受害人仍将遭到保险保证，并且Medicare仍将处置医疗机构的报销付出。不外一旦“关门”工夫拖长，相干的查对将会延缓。并且，估计Medicaid的参保人数和对医疗机构的报销付出都不会因当局“关门”而削减，别的兜揽新参保职员由各州卖力，因而这方面也不会遭到影响。因为“非必须岗亭职员”“被休假”，联邦当局在突发大众卫生危急应对上也会反响变慢。虽然针对美国十余年来最严峻的流感季的告急呼应会不受滋扰地连续下去，可是有关新疾病发作的联邦查询拜访，在当局“关门”时期将会较着变得缓慢。

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